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由于工业企业产品成本计算方法复杂，会计核算工作量大。因此，注册税务师在进行纳税审查时，应当借助企业内部控制制度的效用，通过了解企业内部控制制度是否存在及对遵守性的测试，分析找出企业存在的薄弱环节和可能存在的问题，进而有选择、有目的、有重点地审查，这样既能降低审查工作量，又能确保审查质量。
企业的内部控制是指企业的内部管理控制系统，包括为保证企业正常经营所采取的一系列必要的管理措施。内部控制的职能不仅包括企业最高管理当局用来授权或指挥进行购货、生产、销售等经营活动的各种方式方法，也包括核算、审核、分析各种信息资料及报告的程序与步骤，还包括为对企业经营活动进行综合计划，控制和评价而制定或设置的各种规章制度。因此，内部控制的作用能够提高会计核算的正确性和可靠性。
企业的内部控制制度主要包括下列内容：
⒈可靠的内部凭证制度。企业有完善的内部控制凭证，以种类全、内容完整、连续编号的一些处理经济业务的凭证，作为会计处理依据。
⒉完善的簿记制度。在可靠的凭证制度基础上，建立完整的账簿和报表制度，确保会计记录的严密性。
⒊严格核对制度。包括凭证之间的核对，凭证和账簿之间的核对，账簿和报表之间的核对等。企业建立严格的核对制度，有利于及时改正会计记录中错误，做到证、账、表三相符。
⒋合理的会计政策和会计程序。企业在遵守国家制定的会计准则的基础上，还从本单位会计工作实际出发，建立自己的合理会计政策和会计程序，以书面文字形式，作为会计处理方法的依据。
⒌定期资产盘点制度。
对上述内部控制制度会计体系可靠程度进行遵守性的调查：
第一、采用询问法。询问企业是否具有健全的内部控制制度。可以采取问卷的形式设计调查表格，将你想要询问的项目按其重要性依次排列。对想要问的内容及企业回答，要逐项进行并做好记录，使你在很短的时间内对企业生产环节的业务流程、控制程序、核算方法有所认识。
第二、采用抽查法。验证内部控制是否一直在运行，是否取得了预期效果，在多大程度上确保核算的正确性。我们可以对上述的询问内容，选择对成本影响最大的项目，抽取样本—原始单据、凭证进行查看，并对企业回答进行核对，判断其内部控制的有效性。
通过询问和抽查，对被查企业的内部控制制度，我们可得出这几种结论：
第一、依赖程度高。被查企业具有健全、完善的内部控制制度，并且均能有效发挥作用。因此，经济业务和会计核算发生差错的可能性很小，可以相应对该环节减少审查的工作量，甚至于可以不查。
第二、依赖程序一般。企业内部控制制度较为良好，但存在一定缺陷或薄弱环节，在某种程度上可能影响会计核算的准确性与可靠性，可以对薄弱环节项目进行较为深度的审查。
第三、依赖程度低。企业内部控制制度明显失效，大部分经济业务和会计记录失控，各项资料和数据经常出错，从而导致无法依赖。在这种情况下，必须开展制造成本详细审查。
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